Кімнати прибуткових будинків зайняли сотні співробітників, а колишні нумери «Імперіал» перетворилися на сумно знамениту внутрішню в'язницю. З того часу будинок на Луб'янській площі постійно займали спецслужби — ОГПУ, НКВС та МВС, НКДБ, МДБ та КДБ СРСР. З 1996 року тут працює ФСБ.
1946-го НКВС перетворили на МВС, на базі якого з 1954-го функціонувало КДБ СРСР. Після розпаду СРСР у будівлі на Луб'янської площі розташовувалися головні російські спецслужби, які також неодноразово змінювали офіційні назви. З 1996 року комплекс займає ФСБ. Апарат органів державної безпеки постійно розширювався.
У четвер 19 грудня 2019 року близько 18 години Євген Манюров, перебуваючи біля приймальної ФСБ на Луб'янці, відкрив стрілянину по співробітникам ФСБ із напівавтоматичного карабіна «Сайга» Шестеро людей було поранено, згодом один із них помер у лікарні.
Слідчі, що по черзі змінювалися, допитували людину протягом кількох діб поспіль з перервами на короткий, не більше години, сон. Після трьох діб інтенсивних допитів, у проміжках між якими підслідний занурювався над сон, а тривожне забуття, нерідко з галюцинаціями, він втрачав почуття часу.