На медіальному краї нирки знаходяться ворота нирки, які продовжуються у простір усередині нирки – ниркову пазуху. У ворота нирки входять ниркова артерія та нерви, виходять ниркова вена, лімфатичні судини та сечоводу. У нирковій пазусі знаходяться ниркова балія, судини, нерви та жирова тканина.
продовжуються в розширену порожнину органу – ниркову пазуху, sinus renalis, у якій розташовуються малі ниркові чашки, calices renalis minores, великі ниркові чашки, calices renalis majores, та ниркова балія, pelvis renalis.
Сінус, або ворота нирки – це простір, заповнений жировою тканиною, що знаходиться в області її внутрішнього краю.
У клубочках ниркових тілець із плазми крові в процесі ультрафільтрації утворюється первинна сеча, ізоосмотична з плазмою крові. Пори, через які фільтрується плазма мають ефективний середній діаметр 2,9 нм.