Асиметричні кінці ланцюга ДНК називаються 3' (три штрих) та 5' (п'ять штрих). Полярність ланцюга відіграє важливу роль як при синтезі ДНК, так і РНК (подовження ланцюга можливе тільки шляхом приєднання нових нуклеотидів до вільного 3'-кінця). Таким чином, 3'-кінець це ВІН-кінець, а 5'-фосфатний кінець.11 Jul 2016
Найменування атомів вуглецю в нуклеотидах (виходячи з нумерації атомів вуглецю в молекулі цукру пентози) дає початок двом кінцям – 5' і 3' (вимовляються як п'ять-штрих і три-штрих, англ. five prime end, three prime end)".
Таким чином, у ланцюгів молекули ДНК, а також у всіх видів РНК, є два кінці – 3`і 5`. При цьому у дволанцюжкової ДНК орієнтація двох ланцюгів щодо один одного у складі молекули різна: в одного ланцюга ДНК 3`-кінець розташований зліва, а 5`-кінець – праворуч, а в іншої – навпаки.
Зв'язок між нуклеотидами 3´-5´-фосфодіефірна. Зв'язок утворюється між 3´-ОН-групою залишку дезоксирибози одного нуклеотиду і 5´-залишком фосфорної кислоти іншого. У молекули є 3´-кінець і 5´-кінець. одного полінуклеотидного ланцюга.