Бактеріальна клітина складається з клітинної стінки, цитоплазматичної мембрани, цитоплазми з включеннями та ядерного апарату, званого нуклеоїдом. Є інші структури: мезосома, хроматофори, тилакоїди, вакуолі, включення полісахаридів, жирові крапельки, капсула (мікрокапсула, слиз), джгутики, пили.
На відміну від еукаріотів, бактерії не мають обмеженого оболонкою ядра і, в більшості випадків, якихось мембранних органел. Водночас у ряду бактерій є клітинні структури, які мають аналогів у двох інших доменах.
Хімічний склад бактеріальної клітини Бактеріальна клітина на 80-90% складається з води і лише 10% посідає частку сухої речовини. Вода в клітці перебуває у вільному чи пов'язаному стані.
Для бактеріальної клітини характерно наявність кільцевої молекули ДНК, розташованої безпосередньо у цитоплазмі. Ядро, ЕПС та мітохондрії є в еукаріотичних клітинах, а в клітинах прокаріотів вони відсутні.