Перед вживанням папайю слід очистити від шкірки та видалити насіння. Деякі вважають за краще просто розрізати фрукт навпіл, очистити половинки від насіння, і є м'якоть за допомогою ложки.
У центрі плоду багато кісточок, схожих на горошини чорного перцю. Їх легко вискрести з фрукта, що розрізає, за допомогою ложки, ножа або просто пальцями. Зазвичай ці кісточки не їдять: вони тверді та гіркі. Але іноді їх додають у смузі або в соуси.
Папаю можна звичайно додавати в салати, а також застосовувати як інгредієнт джемів, соусів, солінь і соків. Також плоди папайї можна вживати в їжу у вареному вигляді, попередньо посипавши сіллю та перцем. Раніше папайя вважалася екзотичним фруктом, проте тепер її можна, можливо купити скрізь та протягом усього року.
Після розрізання зберігайте шматок, що залишився, в холодильнику разом зі шкіркою і насінням. Насіння папайї їстівні, але у свіжому вигляді вони гіркі. Як та фрукт, вони містять папаїн – фермент, який допомагає перетравлювати білки.