Для виявлення та диференціальної діагностики кишкових інфекцій використовуються культуральні та молекулярно-генетичні методи дослідження генетичного матеріалу збудника в калі та визначення концентрації специфічних імуноглобулінів у крові.
Дослідження дозволяє виявити бактерії роду сальмонела та шигела в калі. Аналіз використовується для диференціальної діагностики гострих кишкових інфекцій.
Метою посіву калу на патогенну кишкову групу є виділення патогенних ентеробактерій, що спричиняють кишкові інфекції. Визначається вид, кількість та антибіотикочутливість та чутливість до бактеріофагів виділених патогенних ентеробактерій.