З профілактичною метою препарат приймають щодня 1 раз на день протягом 1-3 місяців. При гострих проявах генітального герпесу препарат приймають через рівні проміжки часу за наступною схемою: 1-3 день – по 1 таблетці 8 разів на день, далі – по 1 таблетці 4 рази на день не менше 3 тижнів.
Лікування інфекцій, спричинених герпес-вірусами (інфекційний мононуклеоз, вітряна віспа) у складі комплексної терапії. Дітям від 1 року та старше. складає 14 днів. При необхідності препарат можна, можливо поєднувати з іншими противірусними та симптоматичними засобами.
Для профілактики ГРВІ та грипу анаферон застосовується за простою та зручною схемою: 1 раз на день по 1 таблетці сублінгвально. Враховуючи те що анаферон не потрібно запивати водою, препарат особливо зручний для проведення профілактичної роботи у дитячих дошкільних закладах та серед школярів.
Перші 2 год Анаферон приймають кожні 30 хв (5 прийомів), потім протягом 1-ї доби – ще 3 таблетки через рівні проміжки часу (всього 8 таблеток). 2. Починаючи з 2-ї доби і надалі препарат приймають по 1 таблетці 3 рази на добу до одужання.